Die Nyborg Marina umfasst auch einen kleineren Industriehafen, den Fischereihafen.
Der Jollenhafen ist für Jollen ohne Mast ausgelegt.
Der Westhafen liegt direkt neben maritimen Gebäuden, die sowohl Eigentums- als auch Miet- und Genossenschaftswohnungen umfassen.
Der Osthafen liegt fast im Stadtzentrum.
Am November 2019 beschloss der Stadtrat, dass das bisher offiziell benannte Hafengelände Heimdals Plads heißt.
In Kongens Skibsbro kommen das Königsshiff und andere größere Schiffe hinzu, wenn sie die Stadt besuchen.
Der Kanalhafen beginnt am Osthafen und mündet in den ehemaligen Fähranleger der Dänischen Staatsbahnen DSB.
In 2021 Nyborg Marina hast ein komplett neues Bereich eröffnet "Tømmergraven".